Bộ Tài nguyên và Môi trường đã tiến hành thanh tra về bảo vệ môi trường tại 03 Khu công nghiệp, 02 cụm công nghiệp và 17 cơ sở sản xuất, kinh doanh trên địa bàn tỉnh (01 đơn vị đã ngừng hoạt động). Qua thanh tra Bộ Tài nguyên và Môi trường đã có kết luận, xử lý vi phạm và yêu cầu các đơn vị có vi phạm thực hiện các biện pháp khắc phục. Để triển khai thực hiện các ý kiến kết luận thanh tra của Bộ Tài nguyên và Môi trường, Chủ tịch UBND tỉnh giao Sở Tài nguyên và Môi trường chủ trì, phối hợp với Ban Quản lý khu kinh tế, UBND các huyện, thị xã, thành phố tiến hành đôn đốc, kiểm tra việc thực hiện, khắc phục sai phạm của các đơn vị; yêu cầu các đơn vị thực hiện các biện pháp bảo vệ môi trường theo quy định và nội dung báo cáo ĐTM đã được phê duyệt; thực hiện xử lý khí thải, quản lý và xử lý chất thải rắn thông thường, chất thải nguy hại đúng quy định; kê khai và nộp phí bảo vệ môi trường đối với nước thải công nghiệp, chất thải rắn theo quy định. Đồng thời phải tăng cường kiểm tra, giám sát việc thực hiện các yêu cầu về bảo vệ môi trường đối với các cơ sở, dự án đầu tư bên trong khu công nghiệp; rà soát và yêu cầu các doanh nghiệp trong khu công nghiệp đấu nối nước thải vào hệ thống xử lý nước thải tập trung.

Yêu cầu Công ty cổ phần Đầu tư hạ tầng khu công nghiệp Nhơn Hòa xây dựng và vận hành hệ thống xử lý nước thải ổn định, đảm bảo hệ thống hoạt động đúng công suất, hiệu suất và nước thải sau xử lý đạt Quy chuẩn Việt Nam. Yêu cầu Công ty cổ phần Đầu tư và Xây dựng Bình Định khẩn trương lắp đặt hệ thống đo lưu lượng và quan trắc liên tục, tự động một số thông số ô nhiễm đặc trưng trong nước thải sau xử lý như: pH, COD, cặn lơ lửng, amonia, độ màu,… đảm bảo nước thải sau xử lý đạt Quy chuẩn Việt Nam. Phải xem xét, kiểm tra, giám sát quá trình lắp đặt, kết quả quan trắc hệ thống phải phù hợp với kết quả phân tích mẫu nước thải thực tế theo tiêu chuẩn hiện hành; cửa xả nước thải sau xử lý phải được đặt ở vị trí thuận lợi cho việc kiểm tra, giám sát theo quy định của Luật Bảo vệ môi trường.