Tuy nhiên, khi các dự án trên địa bàn KKT Nhơn Hội đi vào xây dựng và hoạt động (nhất là các dự án du lịch, dịch vụ và bất động sản), tình trạng mua, bán, lấn, chiếm và xây dựng trái phép trên địa bàn KKT Nhơn Hội diễn ra phức tạp hơn, nhiều địa phương trở thành điểm nóng về lấn, chiếm đất đai, như: xã Cát Chánh, thị trấn Cát Tiến huyện Phù Cát; xã Phước Hòa huyện Tuy Phước; công tác tham mưu lập hồ sơ xử lý vi phạm hành chính còn nhiều sai sót, có vụ việc phải lập lại hồ sơ xử lý từ đầu, gây khó khăn cho việc xử lý; trong xử lý các vi phạm trên lĩnh vực đất đai nhiều địa phương còn thiếu kiên quyết, có nơi có biểu hiện buông lỏng trong quản lý; hiệu quả xử lý vi phạm đất đai còn thấp, chưa đảm bảo tính răn đe, giáo dục; chưa tích cực giải quyết vấn đề sau xử lý các vi phạm, hầu hết sau xử lý, không kiểm tra, giám sát việc khắc phục nên để đối tượng tiếp tục tác động, có trường hợp đối tượng không chấp hành quyết định nộp phạt nhưng cũng không có giải pháp xử lý triệt để,…

Tính đến nay, trên địa bàn KKT Nhơn Hội vẫn còn 45 trường hợp vi phạm chưa được xử lý dứt điểm, cụ thể: xã Cát Chánh, huyện Phù Cát còn 22 trường hợp, thị trấn Cát Tiến, huyện Phù Cát còn 18 trường hợp;xã Phước Hòa, huyện Tuy Phước còn 04 trường hợp và xã Nhơn Hội, thành phố Quy Nhơn còn 01 trường hợp.

Để giải quyết dứt điểm tình trạng lấn chiếm đất đai, xây dựng nhà trái phép các địa phương phải nâng cao trách nhiệm trong lãnh đạo, chỉ đạo, quản lý điều hành để xử lý hiệu quả tình trạng lấn, chiếm đất đai trên địa bàn Khu kinh tế cần triển khai thực hiện một số giải pháp như sau: 

Một là, cấp ủy, chính quyền cấp xã và thị trấn cần tăng cường nghiên cứu, nắm chắc các quy định của pháp luật về đất đai để lãnh đạo, quản lý, điều hành một cách hiệu quả; nêu cao tinh thần quyết tâm, xác định rõ trách nhiệm và thẩm quyền trong lãnh đạo của từng địa phươngvề thực hiện nhiệm vụ quản lý nhà nước trên lĩnh vực đất đai; thường xuyên kiểm tra, rà soát địa bàn còn diện tích đất chưa sản xuất do nhà nước quản lý để kịp thời phát hiện và xử lý nghiêm các trường hợp lấn, chiếm; quá trình xử lý phải chặc chẽ trong việc lập hồ sơ theo quy định pháp luật; tăng cường quản lý chặc chẽ diện tích đất bị lấn chiếm sau khi xử lý. 

Hai là, đối với Phòng Tài nguyên - Môi trường các huyện cần phối hợp với UBND các xã và thị trấn củng cố chặc chẽ hồ sơ xử lý vi phạm hành chính để đề xuất xử lý hình sự một số vụ việc trọng điểm, để tạo tính răn đe, hạn chế tình trạng lấn chiếm đất đai trái phép. 

Ba là, các ngành chức năng của huyện tăng cường phối hợp chặc chẽ, thường xuyên trao đổi chuyên môn đối với việc xử lý các hành vi lấn chiếm đất đai trái phép; trong đó, chú ý đề xuất xử lý nghiêm túc các trường hợp có hành vi chống đối lực lượng chức năng khi tiến hành xử lý vi phạm hành chính hành vi lấn, chiếm đất.

Bốn là, BQL KKT phối hợp với các địa phương thực hiện tốt Quy chế phối hợp giữa BQL KKT với các cơ quan, đơn vị, địa phương trong công tác phát hiện, xử lý các trường hợp lấn chiếm đất đai trên địa bàn KKT Nhơn Hội (theo Quyết định số 805/QĐ-UBND ngày 14/3/2019 của UBND tỉnh), khi có vi phạm xảy ra sẽ đề nghị UBND tỉnh xác định trách nhiệm và xử lý cụ thể đối với tập thể, cá nhân liên quan.