Đối với việc thẩm định và hậu thẩm định báo cáo đánh giá tác động môi trường (ĐTM) thì tổ chức thẩm định Báo cáo ĐTM của dự án đầu tư trên địa bàn tỉnh thuộc thẩm quyền thẩm định của UBND tỉnh, trừ các dự án đầu tư xây dựng trong Khu kinh tế Nhơn Hội và các khu công nghiệp, cụm công nghiệp do Ban Quản lý khu kinh tế trực tiếp quản lý. Sau khi hoàn thành công tác thẩm định, Sở Tài nguyên và Môi trường có trách nhiệm tổng hợp, trình UBND tỉnh xem xét, phê duyệt theo thẩm quyền. Tổ chức kiểm tra và cấp Giấy xác nhận việc đã thực hiện các công trình, biện pháp bảo vệ môi trường phục vụ giai đoạn vận hành dự án. Xem xét, quyết định những thay đổi so với nội dung Báo cáo và yêu cầu của Quyết định phê duyệt Báo cáo ĐTM, Báo cáo ĐTM bổ sung.

Công tác quản lý nhà nước đối với chất thải nguy hại (CTNH): cấp, thu hồi Giấy phép hành nghề quản lý CTNH cho các doanh nghiệp có địa bàn hoạt động trong tỉnh.

Đối với việc thẩm định dự án cải tạo, phục hồi môi trường (CTPHMT): thẩm định Dự án CTPHMT thuộc thẩm quyền của UBND tỉnh, trừ dự án khai thác khoáng sản trong Khu kinh tế Nhơn Hội và các khu công nghiệp, cụm công nghiệp do Ban Quản lý khu kinh tế Nhơn Hội trực tiếp quản lý. Sau khi hoàn thành công tác thẩm định, Sở Tài nguyên và Môi trường có trách nhiệm tổng hợp trình UBND tỉnh xem xét, phê duyệt Dự án CTPHMT. Thực hiện kiểm tra và cấp Giấy xác nhận về việc đã hoàn thành từng phần hoặc toàn bộ nội dung CTPHMT của dự án đã được UBND tỉnh phê duyệt. Xem xét, quyết định những thay đổi so với nội dung Dự án CTPHMT và Dự án CTPHMT bổ sung đã được UBND tỉnh phê duyệt.