Trải qua 40 năm làm nhiệm vụ chiến đấu, phục vụ chiến đấu, chăm sóc sức khỏe và thu dung điều trị, cứu chữa thương bệnh binh cho LLVT Quân khu 5 và các đơn vị của Bộ Quốc phòng ở phía nam Quân khu, Bệnh viện đã lập nên những thành tích xuất sắc, được Đảng và Nhà nước trao tặng danh hiệu Đơn vị Anh hùng LLVT nhân dân thời kỳ đổi mới. Chất lượng khám chữa bệnh và thái độ phục vụ của đội ngũ thầy thuốc Bệnh viện Quân y 13 đã để lại ấn tượng tốt đẹp trong lòng nhân dân trên địa bàn tỉnh Bình Định và các tỉnh lân cận với khoảng 50.000 lượt bệnh nhân đến khám chữa bệnh mỗi năm.